Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM93

Arl6ip4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip4Q9JM93 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Arl6ip4Q9JM93 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Arl6ip4Q9JM93 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms