Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Higd1aQ9JLR9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Higd1aQ9JLR9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Higd1aQ9JLR9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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