Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CubnQ9JLB4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CubnQ9JLB4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms