Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Upk3aQ9JKX8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Upk3aQ9JKX8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms