Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scamp4Q9JKV5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scamp4Q9JKV5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms