Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chrac1Q9JKP8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Chrac1Q9JKP8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms