Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pole3Q9JKP7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pole3Q9JKP7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms