Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
AtrQ9JKK8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AtrQ9JKK8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms