Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rcan3Q9JKK0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rcan3Q9JKK0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms