Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem3Q9JKE1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trem3Q9JKE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms