Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ap3m1Q9JKC8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ap3m1Q9JKC8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms