Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK97

Kcnq4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnq4Q9JK97 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kcnq4Q9JK97 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kcnq4Q9JK97 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms