Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cnga3Q9JJZ8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cnga3Q9JJZ8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cnga3Q9JJZ8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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