Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tuba8Q9JJZ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tuba8Q9JJZ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms