Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx20Q9JJY4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx20Q9JJY4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms