Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Riox1Q9JJF3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Riox1Q9JJF3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms