Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI60

Lrat, Lecithin retinol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LratQ9JI60 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LratQ9JI60 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LratQ9JI60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms