Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pus3Q9JI38 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pus3Q9JI38 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms