Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW4

Eefsec, Selenocysteine-specific elongation factor, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EefsecQ9JHW4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
EefsecQ9JHW4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
EefsecQ9JHW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms