Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHJ5

Htr3b, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3bQ9JHJ5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Htr3bQ9JHJ5 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Htr3bQ9JHJ5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms