Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn12Q9ET43 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn12Q9ET43 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms