Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk3Q9ERH7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Hipk3Q9ERH7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms