Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tfcp2Q9ERA0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tfcp2Q9ERA0 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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