Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Clstn2Q9ER65 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Clstn2Q9ER65 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Clstn2Q9ER65 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms