Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcr6Q9EQ16 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cxcr6Q9EQ16 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms