Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Rpgrip1Q9EPQ2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Rpgrip1Q9EPQ2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rpgrip1Q9EPQ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms