Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB8

Vmn1r54, Vomeronasal type-1 receptor 54, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r54Q9EPB8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn1r54Q9EPB8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms