Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ccdc97Q9DBT3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc97Q9DBT3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms