Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ap1s2Q9DB50 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ap1s2Q9DB50 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms