Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB20

Atp5o, ATP synthase subunit O, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5oQ9DB20 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atp5oQ9DB20 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atp5oQ9DB20 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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