Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB10

Smdt1, Essential MCU regulator, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smdt1Q9DB10 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smdt1Q9DB10 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms