Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Q9DAE8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Q9DAE8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Q9DAE8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms