Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ccdc89Q9DA73 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc89Q9DA73 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms