Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp12Q9D9M2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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Usp12Q9D9M2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Usp12Q9D9M2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Usp12Q9D9M2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Usp12Q9D9M2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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