Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atg7Q9D906 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Atg7Q9D906 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms