Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd12Q9D8W5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd12Q9D8W5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Psmd12Q9D8W5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Psmd12Q9D8W5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmd12Q9D8W5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Psmd12Q9D8W5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms