Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SlirpQ9D8T7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SlirpQ9D8T7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms