Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rexo2Q9D8S4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rexo2Q9D8S4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms