Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gtf3c6Q9D8P7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gtf3c6Q9D8P7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c6Q9D8P7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c6Q9D8P7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gtf3c6Q9D8P7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms