Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Lin37Q9D8N6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms