Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N1

Uncharacterized protein C11orf24 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8N1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Q9D8N1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Q9D8N1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9D8N1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms