Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Fip1l1Q9D824 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Fip1l1Q9D824 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms