Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rep15Q9D7T1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Rep15Q9D7T1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rep15Q9D7T1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rep15Q9D7T1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Rep15Q9D7T1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rep15Q9D7T1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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