Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gbe1Q9D6Y9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbe1Q9D6Y9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms