Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slc52a3Q9D6X5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc52a3Q9D6X5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms