Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc94Q9D6J3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms