Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cmtm5Q9D6G9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms