Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam227bQ9D518 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam227bQ9D518 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms