Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V6

Tomm20l, TOMM20-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20lQ9D4V6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tomm20lQ9D4V6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tomm20lQ9D4V6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tomm20lQ9D4V6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms