Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fam90a1bQ9D4F3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fam90a1bQ9D4F3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms